Príprava vektora na expresiu alkohol dehydrogenázy s N-terminálnym glykozylačným miestom v Escherichia coli

Príprava vektora na expresiu alkohol dehydrogenázy s N-terminálnym glykozylačným miestom v Escherichia coli

Celkové hodnotenie

Vedecká práca
100%
Prevedenie (dizajn)
100%
Diskusná interakcia
PoužívateľVedecká prácaDizajnDiskusná interakcia
Mgr. Simona Rezáková100%100%-
ISBN: 978-80-972360-0-7

Príprava vektora na expresiu alkohol dehydrogenázy s N-terminálnym glykozylačným miestom v Escherichia coli

Simona Nôtová1 , Stanislava Bírová , Zdenko Levarski2 , Eva Struhárňanská , Stanislav Stuchlík , Ján Turňa ,
1 Univerzita Komenského v Bratislave, Prírodovedecká fakulta, Katedra molekulárnej biológie, Mlynská dolina, 842 15 Bratislava, Slovenská republika
2 Univerzita Komenského v Bratislave, Univerzitný vedecký park, Ilkovičova 8, 842 16 Bratislava, Slovenská republika
smn.notova@gmail.com

Jedna z mnohých posttranslačných modifikácií, ktorým proteíny podliehajú, je glykozylácia. Napriek dlho pretrvávajúcemu názoru, že N-glykozylácia a O-glykozylácia sú striktne viazané na eukaryotické organizmy, je dnes jasne dokázaná aj ich prítomnosť v baktériách a archeónoch [1]. Z biotechnologického hľadiska, sa prokaryotická glykozylácia stala predmetom záujmu viacerých vedeckých laboratórií a tímov od charakterizácie a úspešného prenosu N-viazanej glykozylačnej dráhy z Campylobacter jejuni do Escherichia coli v roku 2002 [2].   

Cieľom našej práce je expresia glykozylovanej alkohol dehydrogenázy (ADH) zo Saccharomyces cerevisiae s možnosťou imobilizácie prostredníctvom naviazaných glykánov. Jej enzýmová aktivita, ktorá by v ideálnom prípade zostala zachovaná pre biotechnologické účely práve vďaka imobilizácii, predstavuje perspektívny prístup k produkcii dôležitých komponentov potravinárskeho či kozmetického priemyslu [3]. Jeden z prvých medzistupňov k dosiahnutiu konečného cieľa je zároveň predmetom tejto práce, čo obnáša prípravu expresného vektora nesúceho gén kódujúci ADH obohatený o N-terminálne sekvencie rozoznávané enzýmom PglB katalyzujúcim prenos glykánu na Asn zvyšok proteínu (ADHN-GT).

Využitím techník rekombinantnej DNA a analytických metód, ako SDS PAGE a Dot Blot, sme vytvorili stabilný expresný systém E. coli nesúci plazmid s génom pre ADH proteín s N-terminálnymi glykozylačnými miestami (ADHN-GT). Jeho vznik sme dokázali agarózovou elektroforézou a produkcia ADHN-GT bola potvrdená po 24 h expresii metódou Dot Blot. Vzhľadom na možnosť expresie glykozylovaných proteínov len v periplazme bude v budúcnosti potrebné optimalizovať tento krok v rámci expresie ADHN-GT (prípadne iných modifikácií ADH), ako aj efektívnu a spoľahlivú extrakciu proteínov z periplazmatického priestoru. Po zvládnutí týchto krokov budú nasledovať purifikačné prístupy, stanovenie enzýmovej kinetiky a finálny cieľ predstavuje imobilizácia ADH prostredníctvom cukorných zvyškov na vhodnú matricu.

Poďakovanie: 

Príspevok je výsledkom realizácie projektov „Enzýmová produkcia prírodných aromatických aditív“ (APVV–0061–11) a „Univerzitný vedecký park Univerzity Komenského v Bratislave“ (ITMS 26240220086) na základe podpory operačného programu Výskum a vývoj financovaného z ERDF.

Zdroje: 

[1] Abu-Quarn M., Eichler J., Sharon N. (2008) Curr. Opin. Struc. Biol. 18, p. 544.
[2] Wacker M., Linton D., Hitchen P. G., Nita-Lazar M., Haslam S. M., North S. J., Panico M., Morris H. R., Dell A., Wren B. W., Aebi M. (2002) Science 298, p. 1790.
[3] Ben Akacha N., Gargouri M. (2009) Process Biochem. 44(10), p. 1122.

Diskusia