Multilieková rezistencia (MDR) baktérií predstavuje vážny problém v klinickej medicíne. Jeden z aspektov náročnej antibiotickej terapie infekcií spôsobených gram-negatívnymi baktériami je prítomnosť dvoch rôznych membrán, cytoplazmatickej a vonkajšej membrány. Poznáme tri signálne dráhy syntézy jednotlivých komponentov vonkajšej membrány, ktoré sú esenciálne pre jej správnu štruktúru a funkciu: Bam (b-barrel protein transport), LPT (lipopolysaccharide transport) a Lol (lipoprotein transport) [1,2,3]. Poruchy štruktúry vonkajšej membrány gram-negatívnych patogénov vedú k lepšiemu prenikaniu existujúcich antibiotík cez membránu do vnútra baktérií a narušeniu efluxných púmp. Lol signálna dráha pozostáva z piatich proteínov. Bolo preukázané, že u E. coli komplex LolCDE pozostáva z jednej kópie podjednotky LolC a LolE a dvoch kópií podjednotky LolD [4].
Nedávno bola objavená malá molekula s pyrazolovým jadrom, ktorá u E. coli inhibuje zabudovanie lipoproteínov do vonkajšej membrány [5]. Táto zlúčenina inhibuje transport lipoproteínov u E. coli tým, že blokuje ich uvoľňovanie z sféroplastov. Príčinou sú mutácie, ktoré vedú k zmene aminokyselín u oboch LolC a LolE komponentoch. Na druhej strane táto zlúčenina neinhibuje túto signálnu dráhu u baktérie P. aeruginosa. Cieľom našej práce bolo nahradiť esenciálny gén LolCDE z E. coli do P. aeruginosa a odstrániť jeho verziu prítomnú na chromozóme. Ako kontrola bol umiestnený gén LolCDE z E.coli do plazmidu pMMB67EH, čím bola nahradená chromozomálna verziu génu. Ak bude P. aeruginosa s génmi z E. coli životaschopný, bude vystavený molekule, ktorá inhibuje zabudovanie lipoproteínov do vonkajšej membrány u E.coli. Použitie molekuly inhibujúcej rast Gram - negatívnych patogénnych baktérií ako je P. aeruginosa spôsobujúcich mnoho vážnych ochorení je žiadúce, najmä kvôli vzostupu antibakteriálnej rezistencie v posledných rokoch.
E coli vs P aerug sekvencie
Ako velmi sa lisia Lol CDE sekvencie u E.coli a P.aeruginosa? Je zname, ktora cast by mohla byt zodpovedna za rezistenciu na danu zluceninu?