Morfologicko- genetická charakterizácia vláknitých druhov siníc z čeľade Leptolyngbyaceae

Morfologicko- genetická charakterizácia vláknitých druhov siníc z čeľade Leptolyngbyaceae

Celkové hodnotenie

Vedecká práca
100%
Prevedenie (dizajn)
100%
Diskusná interakcia
PoužívateľVedecká prácaDizajnDiskusná interakcia
RNDr. Veronika Jarábková100%100%-
Mgr. Katarína Godovičová100%100%-
RNDr. Zuzana Šramková PhD.100%100%-
RNDr. Lenka Tišáková PhD.100%100%-
ISBN: 978-80-972360-1-4

Morfologicko- genetická charakterizácia vláknitých druhov siníc z čeľade Leptolyngbyaceae

Lenka Raabová1 , Ľubomír Kováčik2 , Otakar Strunecký3
1 Katedra biológie, Univerzita sv. Cyrila a Metoda v Trnave, Trnava, Slovensko
2 Katedra botaniky, Prírodovedecká fakulta Univerzity Komenského v Bratislave, Slovensko
3 Fakulta rybařství a ochrany vod, Jihočeská univerzita v Českých Budějoviciach, České Budejovice, Česká republika
lenka.raabova@gmail.com

Čeľaď Leptolyngbyaceae v súčasnosti patrí k skupinám, v ktorých sa v poslednom čase deje najviac taxonomických zmien a vznikajú z nej každoročne nové rody siníc. Ide o skupinu obsahujúcu veľmi tenké, nepohyblivé, nevetvené vláknité druhy siníc so schopnosťou tvoriť pošvy [1] Významným rodom tejto čeľade je rod Leptolyngbya. Pôvodne bol tento rod založený na druhoch, ktoré boli na základe botanického nomenklatorického kódu priraďované k rodu Phormidium a na základe bakteriologického kódu sa priraďovali k rodom Lyngbya, Plectonema, Phormidium, pod pomenovaním LPP-B group [2] V posledných rokoch sa ukázalo, že ide o polyfyletický rod a odčlenili sa z neho nové, monofyletické rody ako  Haloleptolyngbya [3], Nodosilinea [4] , Stenomitos [5] a iné. Predložená práca študovala 45 unialgálnych kmeňov patriacich do čeľade Leptolyngbyaceae, ktoré boli izolované z oboch polárnych oblastí. Po prevezení na Slovensko boli vyizolované jednodruhové kultúry, ktoré sa následne študovali v optickom mikroskope na zaznamenanie fenotypových znakov a následne sa z nich izolovala celková genomická DNA pomocou SDS extrakcie [6]. Následne sa vzorky dali externe osekvenovať. Boli získané fragmenty 16S rRNA, ktoré boli porovnané z údajmi z databázy GenBank. Na základe týchto porovnaní sa nami študované vzorky rozdelili do 5 genetických skupín, ktoré zodpovedajú rodom Leptolyngyba, Stenomitos, Phormidesmis, Nodosilinea a jeden kmeň zapadá do skupiny tvoriacej samostatnú genetickú vetvu, spĺňajúcu podmienky pre popísanie nového rodu. V rode Phormidesmis sa nám vyčlenili dve vetvy, ktoré spĺňajú podmienky pre vznik nového druhu. Zástupcovia sú charakteristický vyhranenou ekológiou, ako aj špecifickými znakmi akými sú farba vlákien a špecifická tvorba pošiev. V rode Stenomitos sa nám vytvorila skupina kmeňov pochádzajúcich prevažne z chladných biotopov polárnych oblasti, ktorá geneticky a morfologicky spĺňa podmienky pre popis nového druhu.

Poďakovanie: 

Práca vznikla na základe finančnej podpory z grantov FPPV- 18-2017 a APPV SK-CZ-2013-0019. Autori zároveň ďakujú Centru polárnej ekológie za umožnenie výskumu na ich pracovisku, ako aj doc. Ing. Josefovi Elstrovi, CSc. za poskytnutie kultúr potrebných pre výskum.

Zdroje: 

[1]  Komárek et. al., Preslia. 2014, 86, 295-335.
[2] Caroppo et al., Fottea. 2012, 12, 315–326.
[3] Dadheech et. al. Phycologia. 2012, 4, 361–372.
[4] Perkerson et. al., J. phycol. 2011, 47, 1397–1412.
[5] Miscoe et Johansen, Biblioth. Phycol. 2016. 120,152.
[6] Yilmaz et al., 2009, J. Phycol. 45, 517–521.

Diskusia