Zdravim, rad by som sa spytal zopar veci k tejto prezentacii: Inhibitory, ktore su tuna zahrnute maju viacero ionizovatelnych protonov. Moze mat pripadna pH rovnovaha vplyv na viazanie inhibitora v enzyme - a ak ano, tak ako to reflektuje pouzity model?
Latka 12w je "outlier" a zrejme by mala byt vylucena zo statistickeho spracovania. Ak tuto latku vylucime, tak sa skore ostatnych latok pohybuje v rozmedzi cca 7 kcal. Aka je presnost pouzitej qmmm metodiky? Neexistuje nejaky lepsi subor latok, co by sa dal pouzit na validaciu metody (taky, kde by bolo vacsie rozpatie ic50 v ramci suboru a pokial mozno jednoduchsie struktury - menej stupnov volnosti?)
...
Zdravim, rad by som sa spytal zopar veci k tejto prezentacii: Inhibitory, ktore su tuna zahrnute maju viacero ionizovatelnych protonov. Moze mat pripadna pH rovnovaha vplyv na viazanie inhibitora v enzyme - a ak ano, tak ako to reflektuje pouzity model?
Latka 12w je "outlier" a zrejme by mala byt vylucena zo statistickeho spracovania. Ak tuto latku vylucime, tak sa skore ostatnych latok pohybuje v rozmedzi cca 7 kcal. Aka je presnost pouzitej qmmm metodiky? Neexistuje nejaky lepsi subor latok, co by sa dal pouzit na validaciu metody (taky, kde by bolo vacsie rozpatie ic50 v ramci suboru a pokial mozno jednoduchsie struktury - menej stupnov volnosti?)