Regulácia antibiotického klastra auricínu génom aur1O v Streptomyces aureofaciens CCM3239

Regulácia antibiotického klastra auricínu génom aur1O v Streptomyces aureofaciens CCM3239

Celkové hodnotenie

Vedecká práca
100%
Prevedenie (dizajn)
100%
Diskusná interakcia
100%
PoužívateľVedecká prácaDizajnDiskusná interakcia
Mgr. Carmen Bekeová100%100%-
Mgr. Anna Juhásová100%100%-
Mgr. Jana Makroczyová100%100%-
RNDr. Andrea Kuchtová100%100%-
Mgr. Tomáš Grivalský100%100%100%
Mgr. Barbora Kaločayová PhD.100%100%100%
ISBN: 978-80-970712-8-8

Regulácia antibiotického klastra auricínu génom aur1O v Streptomyces aureofaciens CCM3239

Erik Mingyár1 , Renáta Novaková , Ľubomíra Fecková , Carmen Bekeová , Ján Kormanec
1 Ústav molekulárnej biológie SAV, Bratislava,
erik.mingyar@savba.sk

Auricín je angucyklínové antibiotikum produkované polyketid syntázou II typu. Gény kódujúce enzýmy potrebné pre biosyntézu sekundárnych metabolitov sú zväčša usporiadané do klastrov a regulované špecifickými transkripčnými regulátormi CSR (cluster-situated regulators). Gén aur1P kóduje pozitívny regulátor Aur1P, patriaci do rodiny OmpR regulátorov odpovedí. Je exprimovaný z promótora aur1Pp, ktorý je indukovaný v stacionárnej fáze rastu. Negatívny regulátor je kódovaný génom aur1R, divergentne ležiaci ku génu aur1P a patrí do rodiny TetR regulátorov. Naviac je celý klaster regulovaný piatimi génmi patriacimi do rodiny SARP (streptomyces antibiotic regulatory proteins) [1].

Gén aur1O leží vedľa pozitívneho regulátora aur1P, je pravdepodobne kotranskribovaný z aur1Pp promótora a jeho funkcia na základe homologických porovnaní nebola jasná. Preto sme sa rozhodli rozrušiť gén aur1O, čo viedlo k takmer 70% poklesu produkcie antibiotika auricínu bez fenotypickej zmeny kmeňa S. aureofaciens CCM3239. Hmotnostnou spektrometriou sme potvrdili, že rozrušený gén aur1O nemá vplyv na výstavbu antibiotika. Kotranskripcia z  promótora aur1Pp naznačuje úlohu Aur1O v regulácii expresie antibiotika spolu s pozitívnym regulátorom Aur1P a preto sme otestovali proteínovú interakciu medzi týmito dvoma regulátormi BACTH systémom a meraním β-galaktozidázovej aktivity sme stanovili silu interakcie. Doposiaľ získané výsledky naznačujú úlohu Aur1O v koaktivácii expresie antibiotika auricínu.

Poďakovanie: 

Tento projekt bol podporený Agentúrou pre podporu výskumu a vývoja pod číslom grantu APVV-0203-11.

Zdroje: 

[1] Kormanec a kol. 2014. Intriguing properties of the angucycline antibiotic auricin and complex regulation of its biosynthesis. Appl Microbiol Biotechnol. 2014, 98(1), p.45-60

Diskusia

Ahoj Erik, chcem sa opytat ci maju tieto regulatory aur1O a aur1Pp vplyv aj na stabilitu antibiotika ak sa vyskytuju v prostredi. A tiez ci existuju nejake regulatory expresie aj mimo klastrov

Cau Tomas, regulatory ktore studujeme vplyv na stabilitu antibiotika nemaju, su zodpovedne len za jeho produkciu, teda mnozstva kolko sa toho antibiotika vyprodukuje. Ano, existuju regulatory aj mimo klastrov a mozu byt aj pozitivne aj negativne. V nasom pripade sme doposial identifikovali az 5 dalsich regulatorov patriacich do jednej rodiny a niektore z nich maju vplyv na hladinu produkcie nasho antibiotika.