rRNA génový komplex je často využívaný pri skúmaní a identifikácii kvasiniek. Pozostáva z mnohonásobných kópií génových oblastí: 18S, 5.8S, 26(28)S a 5S. 18S predstavuje malú podjednotku (Small subunit – SSU) a 28S je označený ako veľká podjednotka (Large subunit – LSU). Medzi podjednotkami sú vložené ďalšie dva regióny, a to ITS1 a ITS2 región (Internal transcribed spacer region) a IGS1 a IGS2 región (Intergenic spacer region). Génové oblasti u jednotlivých druhov rodu Malassezia majú viac alebo menej konštantnú dĺžku: SSU – 1800 bp, 5.8S – 160 bp, LSU – 3500 bp a 5S – 120 bp.1 Najčastejšie sa pri diagnostike rodu Malassezia využíva PCR ITS2 regiónu s primermi ITS3 a ITS4.2 Tieto primery boli navrhnuté pre diagnostiku fungálnych rodov Candida, Trichophyton, Malassezia, atď.3 Diagnostika malassezií je komplikovaná. Cieľom práce bolo stanoviť citlivosť PCR reakcie s ITS3 a ITS4 primermi pre určenie rodu Malassezia. Pri zisťovaní citlivosti PCR reakcie s jednotlivými pármi primerov sa využil referenčný kmeň M. pachydermatis (CBS 1879). Reakcia zachytáva ešte 1 ng templátovej DNA a je dostatočne citlivá pre bežnú diagnostiku malassezií.
Táto práca bola podporovaná Agentúrou na podporu výskumu a vývoja na základe Zmluvy č. APVV-15-0377.
1SCOTT, D. W., MILLER, W. H., GRIFFEN, C. E.: Muller and Kirk’s small animal dermatology (ed 6). Philadelphia, W.B. Saunders Company, 2001:526.
2YAPAR, N. Epidemiology and risk factors for invasive candidiasis. Ther Clin Risk Manag 2014;10:95-105.
3CABAÑES, F.J. Malassezia Yeasts: How Many Species Infect Humans and Animals? PLoS Pathog 2014;10:1-4.