Streptomycéty sú pôdne mikroorganizmy, ktoré sú zaujímavým objektom štúdia hlavne pre ich bohatý sekundárny metabolizmus. Sekundárne metabolity, produkované rôznymi kmeňmi streptomycét, sú zaujímavým objektom štúdia pre ich potenciálne využitie v rôznych odvetviach ako medicína, potravinárstvo, poľnohospodárstvo a pod. Najzaujímavejšie sekundárne metabolity sú antibiotiká, ktoré streptomycéty produkujú pravdepodobne na ochranu vlastných nahromadených živín [1].
Počas štúdií polyketid syntázového génového zhluku, aur1, ktorý je zodpovedný za tvorbu angucyklického antibiotika auricínu boli sekvenčnou analýzou pozorované gény homologické s génmi pre replikáciu lineárnych plazmidov streptomycét, gény potrebné pre prerozdeľovanie plazmidov a gény kódujúce proteíny, podieľajúce sa na ochrane telomérnych koncov [2].
Metódou pulznej gélovej elektroforézy bol v mikroorganizme Steptomyces aureofaciens CCM3239 identifikovaný lineárny plazmid s veľkosťou 240 kb. Okrem angucyklického antibiotika auricínu, boli na tomto plazmide pozorované aj iné sekundárne metabolity: zhluk génov aur2 kóduje zatiaľ neznámi sekundárny metabolit, zhluk génov bpsA kóduje modrý pigment indigo, zhluk génov pre metabolizmus síry a iné gény, kódujúce potenciálne sekundárne metabolity [2].
Tato publikácia bola podporená Agentúrou pre podporu výskumu a vývoja pod číslom grantu APVV-0203-11
[1] Dyson, P. 2011. Streptomycetes. Molecular biology and biotechnology. Norfolk, UK: Caister Academic Press, 2011. 253 p. ISBN: 978-1-904455-77-6.
[2] Novakova, R. a kol. 2013. The gene cluster aur1 for the angucycline antibiotic auricin is located on a large linear plasmid pSA3239 in Streptomyces aureofaciens CCM 3239. In FEMS Microbiology Letters. ISSN: 1574-6968, 2013, vol. 342, p .130-137.
otazka
Ahoj, Erik chcel by som vediet ake ma auricin antibiotikove spektrum,teda ci je toxicky len pre vybrane mikroorganizmy alebo je ten rozsah vacsi a tiez ci by si mohol najst uplatnenie v priemysle. A este sa chcem opytat akym sposobom si udrziavate plazmid aby nedoslo k strate pri preockovani.
Re: otazka
Zatial vieme, ze ATB auricin je aktvny voci G+ bakteriam, nie je aktivne voci G- bakteriam a hubam, a bol aktivny aj voci urcitym rakovinovym bunkovym liniam. Samozrejme po dokonalom prestudovani dufame, ze bude moct byt toto antibiotikum vyuzivane v medicine.
Plazmid je pritomny v divom type a nie je potrebny ziadny selekcny tlak na jeho udrziavanie. Na plazmide sa nachadzaju geny oznacovane "partitioning" teda zodpovedne za prerozdelovanie plazmidu pocas replikacie.