Identifikácia baktérií rodu Lactobacillus a Lactococcus v sudovanom ovčom syre multiplexnou PCR

Identifikácia baktérií rodu Lactobacillus a Lactococcus v sudovanom ovčom syre multiplexnou PCR

Celkové hodnotenie

Vedecká práca
95%
Prevedenie (dizajn)
88%
Diskusná interakcia
100%
PoužívateľVedecká prácaDizajnDiskusná interakcia
Ing. Monika Kocková PhD.80%60%-
Ing. Milada Rakická80%60%-
Ing. Martina Koňuchová100%80%-
Mgr. Zuzana Čaplová PhD.100%100%-
Veronika Janská100%100%-
Ing. Katarína Ženišová PhD.100%100%-
Ing. Tatiana Mančušková PhD.100%100%100%
Ing. Michal Porubiak100%100%-
ISBN: 978-80-970712-6-4

Identifikácia baktérií rodu Lactobacillus a Lactococcus v sudovanom ovčom syre multiplexnou PCR

Jadža Lejková1 , Ľubomír Valík , Tomáš Kuchta2
1 Fakulta chemickej a potravinárskej technológie STU v Bratislave, Bratislava, Slovenská republika
2 Oddelenie mikrobiológie a molekulárnej biológie,Výskumný ústav potravinársky, Bratislava, Slovenská republika
j.lejkova@gmail.com

Pod pojmom sudovaný ovčí syr rozumieme čiastočne vyzretý, rozdrvený a nasolený ovčí syr z obdobia prebytku ovčieho hrudkového syra,  ktorý je skladovaný v dubových sudoch až do obdobia, kedy sa z takto skladovaného vysoleného ovčieho sudovaného syra a nevysolenej kravskej hrudky vyrába v zimnom období Slovenská zimná bryndza.

V našej práci sme sa zamerali na identifikáciu kyslomliečnych baktérií rodu Lactobacillus  Lactococcus s využitím multiplexnej PCR. Spolu sme identifikovali 36 izolátov z ôsmych vzoriek sudovaného ovčieho syra. Z izolátov čistých kultúr, sme extrahovali DNA pomocou lyzačného roztoku a túto sme ďalej analyzovali pomocou multiplexnej PCR. Priméry využité v tejto práci na identifikáciu baktérií rodu Lactobacillus boli zamerané na amplifikáciu  oblasti 16S-23S rRNA ISR (intergenetický medzerníkový región) a priľahlú oblasť 23S rRNA génu a priméry pre baktérie rodu Lactococcus boli určené na amplifikáciu 16S rRNA génu. Získaný produkt sme vizualizovali 1,5% agarózovou elektroforézou a kapilárnou elektroforézou (QIAxcel). Na základe veľkostí produktov a konečnej špecifickej PCR sme z 36 izolátov potvrdili prítomnosť rodu Lactococcus v 8 vzorkách (Lactococcus lactis subsp. cremoris (1)Lactococcus lactis subsp. lactis (7)) a rod Lactobacillus v 12 vzorkách (Lactobacillus fermentum (3), Lactobacillus casei (4) a pre 5 vzoriek nám chýbali špecifické priméry, avšak v prvom kroku multiplexnej PCR bola potvrdená ich príslušnosť k rodu Lactobacillus).

Poďakovanie: 

Táto práca vznikla vďaka podpore projektu APVV 0590-10.

Zdroje: 

Diskusia