Dobrý den, gratulujem k velmi peknej a zaujímavej práci. Chcel by som sa opýtat, akou metodikou ste sa pokusali najst vhodne kultivacne medium, pouzili ste ja obycajne agary? Obohacovali ste agary o kusky plastov na overenie stiepitelnosti? Dakujem
Dobrý den, gratulujem k velmi peknej a zaujímavej práci. Chcel by som sa opýtat, akou metodikou ste sa pokusali najst vhodne kultivacne medium, pouzili ste ja obycajne agary? Obohacovali ste agary o kusky plastov na overenie stiepitelnosti? Dakujem
Dobry den, dakujem za dobre polozenu otazku. Pouzily sme 10% LB medium (20g agar; 1g tryptone; 0,5g yeast extract; 0,5g NaCl) dopnené do 1L vodou z Dunaja a to z dovodu, aby medium obsahovalo menej environ.mentalne neprirodznenych nutrientov, a zaroven aby obsahovalo specificke latky nachadzaujuce sa vo vode. Teraz pracujeme s s kultivacnymi mediami 10% LB, minmalne medium M9, planujeme 1% LB takisto doplnene vodou z prostredia. Co sa tyka degradacnych vlastnosti, ktore sme testovali tie su predpokladom stiepitelnosti teda depolymerizacie plastov a v najblizsej dobe planujeme testy depolymerizacie PHB.
čau Tomáš, chcem sa ťa opýtať, či existuje nejaký test na stanovenie aktivity novo objaveného biodegradačného enzýmu, alebo či sa porovnávajú novo-objavené biodegradačné enzýmy z nejakým referenčným dnes dobre preštudovaným a komerčne využívaným biodegradačným enzýmom. Chcem sa ešte opýtať, či sa v tejto oblasti výskumu využívajú aj molekulárno-biologické manipulácie na zmenu vlastností (napr. zvýšenie aktivity) biodegradačných enzýmov. ďakujem
Ahoj Erik, jednou z metód na stanovenie aktivity degradačného enzýmu v baktériách je jednoduchá mikrobiologická metóda, kde sa meria veľkosť (v cm) vytvorenej zóny okolo kolónie buniek t.j. zóny ako mám na obrázkoch. Ďalšie často používané metódy, ktoré už presne určia aktivitu biodegradácie sú založené na spektofotometrickom alebo fluorimetrickom meraní uvoľnovaného produktu počas degradácie, napríklad meranie hladiny glukózy pri degradácii celulózy co sa dá aplikovať aj na iné polysacharidov, pričom enzymatická aktivita sa určuje podľa množstva glukózy za 1 minútu. Samozrejme sú dostupné genetické manipulácie, ktoré ovplyňujú expresiu enzýmov avšak z hľadiska aplikovaného výskumu je náročnejšie zaviesť gmo do praxe.
?
Dobrý den, gratulujem k velmi peknej a zaujímavej práci. Chcel by som sa opýtat, akou metodikou ste sa pokusali najst vhodne kultivacne medium, pouzili ste ja obycajne agary? Obohacovali ste agary o kusky plastov na overenie stiepitelnosti? Dakujem
?
Dobrý den, gratulujem k velmi peknej a zaujímavej práci. Chcel by som sa opýtat, akou metodikou ste sa pokusali najst vhodne kultivacne medium, pouzili ste ja obycajne agary? Obohacovali ste agary o kusky plastov na overenie stiepitelnosti? Dakujem
Re: ?
Dobry den, dakujem za dobre polozenu otazku. Pouzily sme 10% LB medium (20g agar; 1g tryptone; 0,5g yeast extract; 0,5g NaCl) dopnené do 1L vodou z Dunaja a to z dovodu, aby medium obsahovalo menej environ.mentalne neprirodznenych nutrientov, a zaroven aby obsahovalo specificke latky nachadzaujuce sa vo vode. Teraz pracujeme s s kultivacnymi mediami 10% LB, minmalne medium M9, planujeme 1% LB takisto doplnene vodou z prostredia. Co sa tyka degradacnych vlastnosti, ktore sme testovali tie su predpokladom stiepitelnosti teda depolymerizacie plastov a v najblizsej dobe planujeme testy depolymerizacie PHB.
otázka
čau Tomáš, chcem sa ťa opýtať, či existuje nejaký test na stanovenie aktivity novo objaveného biodegradačného enzýmu, alebo či sa porovnávajú novo-objavené biodegradačné enzýmy z nejakým referenčným dnes dobre preštudovaným a komerčne využívaným biodegradačným enzýmom. Chcem sa ešte opýtať, či sa v tejto oblasti výskumu využívajú aj molekulárno-biologické manipulácie na zmenu vlastností (napr. zvýšenie aktivity) biodegradačných enzýmov. ďakujem
Re: otázka
Re: otázka
Ahoj Erik, jednou z metód na stanovenie aktivity degradačného enzýmu v baktériách je jednoduchá mikrobiologická metóda, kde sa meria veľkosť (v cm) vytvorenej zóny okolo kolónie buniek t.j. zóny ako mám na obrázkoch. Ďalšie často používané metódy, ktoré už presne určia aktivitu biodegradácie sú založené na spektofotometrickom alebo fluorimetrickom meraní uvoľnovaného produktu počas degradácie, napríklad meranie hladiny glukózy pri degradácii celulózy co sa dá aplikovať aj na iné polysacharidov, pričom enzymatická aktivita sa určuje podľa množstva glukózy za 1 minútu. Samozrejme sú dostupné genetické manipulácie, ktoré ovplyňujú expresiu enzýmov avšak z hľadiska aplikovaného výskumu je náročnejšie zaviesť gmo do praxe.
Re: Re: otázka
daukejm za odpoved.